雖然森田療法理論易懂，操作簡便，但在具體實施時許多細節仍不可忽視，另外森田療法對醫生也有特定的要求。
1.無論是住院或門診治療，都應注意選擇那些除表現為神經質癥狀之外，還應具有某種程度的反省心，自身也在努力改善癥狀，有從癥狀中解脫出來的強烈愿望的患者。僅有某些癥狀而沒有強烈的求治動機是不宜施行森田療法的。若治療之前患者就有嗜睡的現象或賴床的習慣，也不宜施行森田療法。
2.不管是住院或門診治療，在治療前都應當對患者進行詳細的體檢，以排除嚴重軀體疾病的可能并消除患者的疑慮。
3.在施行之前，可以讓患者對森田療法的治療過程有個大致的了解，一般不建議他們事:壺李用寧法的相關？料。對絕對臥床期可能出現的心理狀態，事前不能向患者說明，這點很重要，因為如果患者事前知道在此期間會產生無聊煩悶的情緒，那么他們會采取預期的態度，心理的自然流動就會被歪曲
4、在絕對臥床期間，大多數患者都會感到苦問、無聊，有些患者會因此而使病痛暫時加劇或難以忍受，對治療表示懷疑，少數患者甚至要求終止治療。患者有終止治療的僅力，待醫生講清終止治療的后果后，若患者還是執意要終止治療，醫生須尊重患者的意見，選擇其他療法，或讓他們出院。絕對臥床治療具有嚴格限制人身自由的特點，實施前當事雙方必須簽署必要的協議，以適應當地的法律法規。
5。醫生要囑附患者在治療期間和出院后都不能向親友傾訴、討論癥狀，也囑附其家屬不傾聽和答復他們的傾訴，無論是住院治療還是門診咨詢，都需要說服和鼓勵患者面對現實生活，放棄抵抗癥狀的立場。只有患者接受了森田療法的治療觀點，才能開始治療和取得療效.
6。處于輕體力期和重體力期的患者所從事的活動，都不應有以報酬為目的的體力活動。而應與日常生活緊密聯系在一起。
7.剛結束臥床治療，患者對外面的世界會有新鮮感，加上激發出來的“生的欲望”，他們可能極想放開活動。這時醫生應嚴格限制患者的活動，打籃球、唱歌、看書等過于興奮或激烈的活動都是不允許的。作業應僅限制在輕度范圍之內，否則可能會因過分活動而導致失敗，剛從絕對臥床期出來的患者身體的一些功能還需要慢慢恢復。
8.寫日記是森田療法的重要組成部分，醫生應及時指導患者的日記。為了讓患者重新認識自己行為的作用，醫生要從具體的行為指導入手，對煩惱或痛苦則不予理睬，以使患者的態度從以情緒為中心轉變到以行動為中心。不應讓患者在日記中討論癥狀，也不可讓他們寫得過于豐富，主要是記錄一天的行為及體驗。
9.在日記中有關私生活方面的內容，患者可以另外單獨記下來只供自己看。日記指導只要求患者寫活動體驗與日常生活方式，不愿被人知道的秘密則可以不用寫。日記本應留13的空白地方供醫生寫指導批語，醫生的批語不必詳細解答患者的提問，但應以森田療法的治療原則來指導，如“不能改變情緒變化”、“順其自然”、“馬上轉到行動上來”等。
10.在治療期間，禁止僅僅以消愁解悶為目的的各種活動，如吸煙、聽音樂、喝酒、玩游戲等。神經質的癥狀可因消愁解悶的方法而得到暫時解決，但是，那樣做只不過是精神上的一種暫時性的轉換，過后又會重新恢復原狀。
11.醫生必須具備以下條件（北西憲二，2004）：
(1)能以精神交互作用原理理解病理性精神問題；
(2)能提出針對患者病理性精神問題的治療方法，能選擇并組合住院式、門診式和自助式森田療法；
(3)能使用適當的干預手段打破精神交互作用的惡性循環：
(4)有能力對患者的日記給予合適的指導和評論：
(5)能理解森田療法的治療進程，能夠澄清患者在治療過程中的體驗：
(6)能夠正確理解森田療法的治療目標，并適時終止治療。施行住院治療時，合格的森田治療師還要追加以下6項條件：
(1)能選擇合適的住院對象；
(2)能引導患者住院：
(3)對絕對臥床期的患者能作出合適的指示：
(4)能理解情感的活動規律，并能對其作出適當的干預；
(5)理解治療設置和治療師的作用，特別是理解“不問技術”的意義和對“不問技術應用：
(6)出院時能評定癥狀的改善程度。