超個人心理治療在西方國家已經得到廣泛應用，盡管其理論有很多主觀猜測，但在實際運用中它含有很多科學的成分。從它產生之日起，就在一些特殊領域得到有效應用。研究發現，超個人心理治療在心理疾病治療、生理功能改善、智力發展、道德水平提升、自我意識發展以及自我實現等方面都有積極的作用。通過超個人意識訓練，還可以控制自主神經系統和軀體過程，起到改善心率、降低血壓等作用。超個人心理治療還可以應用到教育實踐，比如將體驗練習技術用到課堂教學，它對學生的學習和生活具有很大幫助。還有人將超個人心理治療用于治療酒精濫用患者和吸毒人員，實踐證明，超個人心理治療在這些領域也有較好的療效。